Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRIP3Q9NQ35 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms