Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms