Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBN1Q9NPG3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBN1Q9NPG3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms