Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GOPCQ9HD26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOPCQ9HD26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms