Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms