Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC113Q9H0I3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC113Q9H0I3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC113Q9H0I3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms