Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NYXQ9GZU5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NYXQ9GZU5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms