Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms