Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms