Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX4Q9BYU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms