Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC2Q9BYS8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms