Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms