Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KATNB1Q9BVA0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms