Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTKNQ9BST9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTKNQ9BST9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms