Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms