Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF8Q9BRL6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms