Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms