Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms