Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms