Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD5Q99666 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms