Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms