Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1CQ96SD1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms