Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A12Q96S37 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A12Q96S37 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms