Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms