Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms