Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf48Q96LL4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf48Q96LL4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms