Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNDP1Q96KN2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNDP1Q96KN2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms