Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM3Q96HU1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM3Q96HU1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms