Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT2BQ96GJ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms