Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALML4Q96GE6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms