Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNFT2Q96EX2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNFT2Q96EX2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms