Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PABPC5Q96DU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms