Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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