Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF428Q96B54 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF428Q96B54 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms