Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM18Q96B42 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM18Q96B42 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms