Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms