Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MKL1Q969V6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms