Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFKQ969G6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFKQ969G6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms