Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC4Q92889 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC4Q92889 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms