Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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RABGGTAQ92696 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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