Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4AQ8WYN0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4AQ8WYN0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms