Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf54Q8WWF1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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