Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC107Q8WV48 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms