Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3TC2Q8TF17 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3TC2Q8TF17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms