Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms