Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms