Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71DQ8N9W8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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