Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTL3Q8N8U3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTL3Q8N8U3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms