Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC105Q8IYK2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC105Q8IYK2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms