Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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